(1)作為軟件得到重點保護的依據(jù)
《國務院關于印發(fā)鼓勵軟件產業(yè)和集成電路產業(yè)發(fā)展若干政策的通知》第三十二條規(guī)定：“國務院著作權行政管理部門要規(guī)范和加強軟件著作權登記制度，鼓勵軟件著作權登記，并依據(jù)國家法律對已經登記的軟件予以重點保護�！�
(2)減免稅收的依據(jù)
財政部、國家稅務總局《關于貫徹落實〈中共中央、國務院關于加強技術創(chuàng)新，發(fā)展高科技，實現(xiàn)產業(yè)化的決定〉有關稅收問題的通知》中對軟件產品的稅收優(yōu)惠有詳細的規(guī)定�？赊k理雙軟，減免增值稅和企業(yè)所得稅�？赊k理高新，減免企業(yè)所得稅。
(3)作為無形資產出資入股
《關于以高新技術成果出資入股若干問題的規(guī)定》規(guī)定計算機軟件可以作為高新技術出資入股，而且作價的比例可以突破公司法20%的限制達到35%�，F(xiàn)在有的地方更規(guī)定軟件可以作價100%以技術出資的規(guī)定。
(4)作為申請科技成果的依據(jù)
可作為高新企業(yè)認定等重要的科技成果�？茖W技術部關于印發(fā)《科技成果登記辦法》的通知第八條規(guī)定：“辦理科技成果登記應當提交《科技成果登記表》及下列材料：（一）應用技術成果：相關的評價證明（鑒定證書或者鑒定報告、科技計劃項目驗收報告、行業(yè)準入證明、新產品證書等）和研制報告；或者知識產權證明（專利證書、植物品種權證書、軟件登記證書等）和用戶證明�！边@里的登記可以理解為著作權的登記，其他部委也有類似規(guī)定，以軟件申請技術成果應當遞交軟件登記證書。
除此之外，軟件著作權登記還有更為現(xiàn)實的意義，就是享有軟件著作權證明作用。軟件由一系列的代碼組成，稱為源代碼，其可以無限制的復制。軟件著作權所保護的是源代碼。一般認為誰持有源代碼，誰既是著作權人，由于源代碼的可復制性，不象復制紙質材料那樣，可以區(qū)分原始與復制件，假使源代碼保密不嚴，就很難區(qū)分著作權人。如果盡早進行著作權登記，取得《軟件著作權登記證書》，這就是初步的權利證明。在發(fā)生軟件著作權爭議時，是主張軟件權利的有力武器，而要證明《軟件著作權登記證書》并非真正軟件著作權人，在舉證上具有相當難度。在進行軟件著作權貿易時，《軟件著作權登記證書》有利于交易的順利完成。